Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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