Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
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UBE4AQ14139 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE4AQ14139 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
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UBE4AQ14139 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE4AQ14139 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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UBE4AQ14139 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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UBE4AQ14139 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE4AQ14139 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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UBE4AQ14139 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4AQ14139 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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UBE4AQ14139 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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UBE4AQ14139 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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UBE4AQ14139 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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UBE4AQ14139 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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UBE4AQ14139 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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UBE4AQ14139 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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