Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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