Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1A4Q13733 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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