Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP1Q13363 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP1Q13363 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP1Q13363 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP1Q13363 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP1Q13363 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP1Q13363 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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CTBP1Q13363 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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CTBP1Q13363 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP1Q13363 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP1Q13363 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms