Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT88Q13099 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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