Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BPTFQ12830 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms