Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms