Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms