Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms