Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB1Q02641 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms