Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA4AP68366 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA4AP68366 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms