Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVK-24P63145 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms