Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBX1P62877 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBX1P62877 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBX1P62877 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBX1P62877 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBX1P62877 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBX1P62877 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBX1P62877 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBX1P62877 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBX1P62877 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBX1P62877 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBX1P62877 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms