Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms