Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK1P53667 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIMK1P53667 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIMK1P53667 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK1P53667 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK1P53667 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK1P53667 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK1P53667 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.6 ms