Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNN1BP51168 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNN1BP51168 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms