Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGS4P49798 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGS4P49798 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGS4P49798 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGS4P49798 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGS4P49798 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGS4P49798 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGS4P49798 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGS4P49798 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGS4P49798 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms