Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR3P49682 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms