Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA4P48058 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms