Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms