Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP62P37198 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP62P37198 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP62P37198 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP62P37198 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP62P37198 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP62P37198 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP62P37198 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP62P37198 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP62P37198 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP62P37198 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms