Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD12P35452 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms