Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.397e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-211ENST00000497582 1075 ntTSL 325.39■■□□□ 1.667e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.237e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-206ENST00000435310 507 ntTSL 219■□□□□ 0.637e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -07e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 TMEM9-205ENST00000414605 545 ntTSL 212.25□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 323.69■■□□□ 1.386e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.441e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 527.32■■□□□ 1.961e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 326.77■■□□□ 1.881e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 57.71□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 322.73■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 517.84■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 47.72□□□□□ -1.175e-13■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 24.06□□□□□ -1.765e-13■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 NAB1-207ENST00000426601 545 ntTSL 418.43■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 NAB1-209ENST00000448811 590 ntTSL 411.95□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 NAB1-204ENST00000416973 568 ntTSL 411.57□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 STK24-205ENST00000444574 1590 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC13.38□□□□□ -0.275e-12■■■■■ 37.7
GTF2F1P35269 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-13■■■■■ 37.6
GTF2F1P35269 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 214.94□□□□□ -0.023e-13■■■■■ 37.6
GTF2F1P35269 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.923e-13■■■■■ 37.6
GTF2F1P35269 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 46.99□□□□□ -1.293e-13■■■■■ 37.6
GTF2F1P35269 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 45.53□□□□□ -1.523e-13■■■■■ 37.6
GTF2F1P35269 CSNK1G1-218ENST00000635529 814 ntTSL 520.17■□□□□ 0.821e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-209ENST00000634259 825 ntTSL 513.07□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-204ENST00000635160 692 ntTSL 48.7□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-213ENST00000634538 924 ntTSL 58.47□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-210ENST00000635593 668 ntTSL 58.47□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-211ENST00000560278 595 ntTSL 47.68□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-208ENST00000635511 920 ntTSL 57.68□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-205ENST00000635704 670 ntTSL 36.94□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 56.55□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-214ENST00000635320 568 ntTSL 46.17□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 56.04□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-212ENST00000635413 706 ntTSL 56□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-206ENST00000635605 757 ntTSL 55.68□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-215ENST00000558783 726 ntTSL 54.88□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 AC087632.1-207ENST00000634529 372 ntTSL 44.21□□□□□ -1.741e-8■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-15■■■■■ 37.5
GTF2F1P35269 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 225.13■■□□□ 1.614e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 223.36■■□□□ 1.334e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.914e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 PRR5-211ENST00000475850 1965 ntTSL 219.93■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 218.99■□□□□ 0.634e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 28.57□□□□□ -1.044e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 319.07■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 217.81■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 523.6■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 223.49■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-216ENST00000477983 605 ntTSL 26.55□□□□□ -1.364e-12■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 LMBR1-212ENST00000448926 3629 ntTSL 24.63□□□□□ -1.674e-12■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MMP17-210ENST00000545671 775 ntTSL 326.76■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MMP17-211ENST00000545790 552 ntTSL 225.25■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.767e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.547e-10■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.824e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.334e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CRLF3-203ENST00000578692 1392 ntTSL 217.8■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)29.9■■■□□ 2.384e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 RPS7-209ENST00000491937 987 ntTSL 229.89■■■□□ 2.384e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.053e-8■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.727e-12■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.624e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.524e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.244e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.244e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 MAEA-209ENST00000506530 5371 ntTSL 222.43■■□□□ 1.184e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.165e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-210ENST00000591732 578 ntTSL 421.85■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-213ENST00000592033 502 ntTSL 221.85■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 37.4
GTF2F1P35269 CANT1-203ENST00000586916 769 ntTSL 321.85■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 37.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 82.3 ms