Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT1P26572 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms