Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNE1P24864 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms