Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA1P22314 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA1P22314 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA1P22314 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA1P22314 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA1P22314 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA1P22314 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA1P22314 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA1P22314 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA1P22314 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA1P22314 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA1P22314 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA1P22314 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA1P22314 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA1P22314 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA1P22314 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms