Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BGNP21810 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BGNP21810 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BGNP21810 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BGNP21810 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BGNP21810 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BGNP21810 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BGNP21810 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BGNP21810 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BGNP21810 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BGNP21810 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BGNP21810 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BGNP21810 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BGNP21810 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BGNP21810 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BGNP21810 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms