Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNA2P20248 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNA2P20248 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms