Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF4P18085 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF4P18085 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF4P18085 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF4P18085 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF4P18085 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF4P18085 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARF4P18085 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF4P18085 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF4P18085 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF4P18085 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF4P18085 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF4P18085 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARF4P18085 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARF4P18085 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARF4P18085 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARF4P18085 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARF4P18085 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARF4P18085 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARF4P18085 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF4P18085 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF4P18085 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF4P18085 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF4P18085 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARF4P18085 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARF4P18085 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARF4P18085 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARF4P18085 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARF4P18085 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARF4P18085 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARF4P18085 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARF4P18085 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARF4P18085 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARF4P18085 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms