Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF3P15923 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF3P15923 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF3P15923 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF3P15923 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF3P15923 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF3P15923 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF3P15923 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF3P15923 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF3P15923 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF3P15923 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms