Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMC1P11047 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms