Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRR29P0C7W0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRR29P0C7W0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms