Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT19P08727 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT19P08727 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT19P08727 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT19P08727 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT19P08727 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT19P08727 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT19P08727 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT19P08727 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT19P08727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT19P08727 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT19P08727 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT19P08727 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT19P08727 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT19P08727 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT19P08727 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT19P08727 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms