Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSF1RP07333 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms