Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC2P02585 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms