Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRUB2O95900 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRUB2O95900 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms