Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MAP4K4O95819 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MAP4K4O95819 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MAP4K4O95819 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP4K4O95819 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP4K4O95819 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms