Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA4FO95754 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms