Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX6O95503 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX6O95503 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX6O95503 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX6O95503 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX6O95503 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX6O95503 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX6O95503 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX6O95503 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX6O95503 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms