Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC2O95409 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC2O95409 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms