Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA2O75334 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA2O75334 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms