Protein–RNA interactions for Protein: O60813

PRAMEF11, PRAME family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11O60813 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF11O60813 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF11O60813 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF11O60813 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF11O60813 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF11O60813 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRAMEF11O60813 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF11O60813 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms