Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL41O60662 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms