Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC28A2O43868 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC28A2O43868 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms