Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC1O14908 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.4 ms