Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F3O00716 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F3O00716 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F3O00716 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F3O00716 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F3O00716 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F3O00716 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F3O00716 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F3O00716 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F3O00716 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F3O00716 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F3O00716 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F3O00716 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F3O00716 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F3O00716 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms