Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1FO00160 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO1FO00160 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms