Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QQQ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QQQ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms