Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMKR1H3BMG3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms